Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «ЭФФЕКТИВНОСТЬ ПРОГРАММ, ПРЕДСКАЗЫВАЮЩИХ МИКРОРНК-МРНК ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ, "Молекулярная биология"»

Авторы:
  • Плотникова О. М.1
  • Скоблов М.Ю.2
стр. 543-554
Платно
1 Московский физико-технический институт (государственный университет), 2 Медико-генетический научный центр Российской академии медицинских наук, Москва, 115478
Ключевые слова:
  • микроРНК-мРНК взаимодействия
  • сайты связывания микроРНК
  • CLASH
  • программа по предсказанию miРНК-мРНК взаимодействий
  • TargetScan
  • PicTar
  • PITA
  • RNA22
  • miRanda
  • miRNA
  • miRNA binding sites
  • mRNA interaction
  • miRanda
  • RNA22
  • PITA
  • CLASH
  • prediction program
  • TargetScan
  • Pic- Tar
Аннотация:
МикроРНК (miРНК) играют ключевую роль в регуляции экспрессии генов в клетках. Для человека известно более 2500?miРНК, однако для большинства из них до сих пор не выявлены взаимодействия с мРНК. Используя результаты недавно разработанного высокопроизводительного метода CLASH (crosslinking, ligation and sequencing of hybrids), распознающего miРНК и взаимодействующего с ней региона мРНК, мы провели анализ miРНК-мРНК интерактома человека и оценили эффективность наиболее часто используемых программ, предсказывающих miРНК-мРНК взаимодействия: TargetScan, PicTar, PITA, RNA22 и miRanda. Анализ эффективности предсказательных алгоритмов проводили по следующим параметрам: чувствительность, положительная прогностическая значимость, анализ взаимодействующих регионов мРНК (кодирующая область, 3?- и 5?-некодирующие области), классы взаимодействий (5?классов), каноничность и неканоничность взаимодействий, сравнение со случайно генерируемыми наборами данных. Выявлен низкий уровень эффективности предсказательных программ в сравнении с экспериментальными данными CLASH по всем исследуе­мым параметрам.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.  

 

* - цена актуальна только для физических лиц
В т.ч. НДС 20%