Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «РАСПОЗНАВАНИЕ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ, ОБУСЛАВЛИВАЮЩИХ СПЕЦИФИЧНОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ПРОТЕИНКИНАЗ С НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНЫМИ ИНГИБИТОРАМИ, "Молекулярная биология"»

Авторы:
  • Карасев Д. А.1
  • Веселовский А.В.2
  • Лагунин А.А.3
  • Филимонов Д. А.4
  • Соболев Б. Н.5
стр. 555-564
Платно
1 Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Министерства здравоохранения Российской Федерации, 2 Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-исследовательский институт биомедицинской xимии им. В.Н. Ореховича» РАМН, 3 Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова, 4 Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича, 5 Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича
Ключевые слова:
  • протеинкиназы
  • низкомолекулярные лиганды белков
  • ингибиторы протеинкиназ
  • специфичные аминокислотные позиции
  • локальное сходство последовательностей
  • protein kinases
  • small molecule ligands of proteins
  • protein kinase inhibitors
  • specific amino acid residues
  • local sequence similarity
Аннотация:
Выявление аминокислотных остатков, определяющих специфичное взаимодействие белков с низкомолекулярными лигандами, необходимо для поиска лекарственных мишеней, конструирования лекарств и решения других биотехнологических задач. Мы исследовали применимость оригинального метода SPrOS (Specificity Projection On Sequence), который направлен на выявление функционально значимых позиций в аминокислотных последовательностях белков. Метод позволяет определять остатки, специфичные для функциональных подгрупп белкового семейства по сходству их локального окружения в аминокислотных последовательностях. Оценку эффективности метода проводили на семействе протеинкиназ. Предсказывали остатки, определяющие специфичность протеинкиназ к их ингибиторам. Результаты проверяли по трехмерным структурам комплексов белок-лиганд. При исследовании взаимодействия протеинкиназ с тремя ингибиторами показано, что предсказанные методом SPrOS остатки либо контактируют с ингибитором, либо влияют на конформацию лигандсвязывающей области. Исключение близких гомологов из исследуемой выборки позволило уменьшить число трудно интерпретируемых позиций, так как часть консервативных позиций в наиболее сходных последовательностях могла быть связана с филогенетическим родством, но не с изучаемой функцио­нальной характеристикой. Таким образом, эффективность метода подтверждена сопоставлением результатов прогноза и трехмерных структур исследуемых белков.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.  

 

* - цена актуальна только для физических лиц
В т.ч. НДС 20%