Статья «МОЛЕКУЛЯРНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ИЗОЛЯТОВ ВИРОИДА ВЕРЕТЕНОВИДНОСТИ КЛУБНЕЙ КАРТОФЕЛЯ ИЗ КОЛЛЕКЦИИ ВСЕРОССИЙСКОГО НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКОГО ИНСТИТУТА ФИТОПАТОЛОГИИ, "Молекулярная биология"»

Определена полная нуклеотидная последовательность более чем ста изолятов вироида веретеновидности клубней картофеля (ВВКК), собранных в различных местностях на территории России и бывшего СССР. Обнаружено 42 варианта первичных структур, каждый из которых содержит от одной до десяти мутаций по сравнению с “intermediate”, или типичным (эталонным), штаммом ВВКК (GenBank Acc. No. V01465). Наиболее часто встречаются изоляты, содержащие от двух до пяти мутаций; 24 варианта последовательностей описаны здесь впервые. В 21 изоляте ВВКК имеется мутация, до сих пор обнаруживавшаяся только у российских и украинских изолятов, ? замена аденина в положении 121 на цитозин (А121С). Большинство изолятов содержат по две мутации ? делецию одного из трех остатков аденина в положении 118-120 и замену аденина в позиции 121 на урацил или цитозин (-А120, A121U/C). Обе комбинации мутаций имеют фенотипически нейтральный характер, т.е. не влияют на характер симптомов болезни томата сорта Ратджерс. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей различных изолятов ВВКК, представленных в настоящей работе, и последовательностей других природных изолятов из базы данных позволяет разделить все известные ВВКК на четыре группы. Первая ? изоляты из картофеля, томата и декоративных культур семейства <i>Solanaceae</i>, для которой типичный (“эталонный”) штамм ВВКК (PSTVd.018) может рассматриваться в качестве “родоначальника”. Вторая группа ? изоляты из картофеля, томата и декоративных культур из семейства <i>Solanaceae</i>, в которой изолят PSTVd.123 играет ту же роль, что изолят PSTVd.018 в первой группе. Третья ? изоляты из картофеля, “родоначальной” последовательностью в которой может быть последовательность изолята PSTVd.125. Четвертая и филогенетически наиболее далеко отстоящая группа изолятов ВВКК значительно отличается от первых трех. Большая часть изолятов этой группы происходит из Новой Зеландии и Австралии, они инфицируют различные виды растений из семейства пасленовых (томат, перец, физалис, картофель и другие).