Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «ПРОГРАММА ALLPRED ДЛЯ ПРЕДСКАЗАНИЯ АЛЛЕРГЕННОСТИ БАКТЕРИЙ И?АРХЕЙ, "Молекулярная биология"»

Авторы:
  • Брагин А. О.1
  • Соколов В.С.2
  • Деменков П.С.3
  • Иванисенко Т. В.4
  • Брагина Е.Ю.5
  • Матушкин Ю. Г.6
  • Иванисенко В.А.7
стр. 326-332
Платно
1 Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, 2 Институт электрохимии им. А.Н. Фрумкина РАН, 119991, Москва, Ленинский просп., 31, Россия, 3 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии и генетики СО РАН, 4 Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, 5 Научно-исследовательский институт медицинской генетики СО РАМН, 6 Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, 7 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии и генетики СО РАН
Ключевые слова:
  • патогенные микроорганизмы
  • предсказание аллергенности
  • экспрессия белков
  • pathogenic microorganisms
  • allergenicity prediction
  • protein expression
Аннотация:
В настоящее время аллергические заболевания имеют широкое распространение. В?связи с?этим разработка компьютерных программ, предназначенных для предсказания аллергенных свойств белков - одна из актуальных задач современной биоинформатики. В?данной работе создана web-версия программы AllPred (http://www-bionet.sscc.ru/psd/cgi-bin/programs/Allpred/allpred.cgi), предназначенной для оценки аллергенности белков с?учетом характеристик их пространственной структуры. С?использованием разработанной программы проведено предсказание аллергенности белков 462 видов архей и?бактерий, для которых доступны полногеномные данные. Проведенный анализ показал, что предсказанные аллергены встречаются чаще среди белков архей, чем среди белков бактерий. Разделение белков на группы по их внутриклеточной локализации показало наиболее частую встречаемость аллергенов среди секретируемых белков. Применение методов предсказания уровня экспрессии генов микроорганизмов на основе анализа последовательностей ДНК позволило обнаружить статистически значимую зависимость между уровнем экспрессии и?предсказанной аллергенностью белков. Оказалось, что аллергенные белки чаще встречаются среди высокоэкспрессирующихся. При разбиении микроорганизмов на патогенные и?непатогенные оказалось, что патогенные микроорганизмы могут обладать повышенной аллергенностью в?связи со статистически значимо большей долей предсказанных аллергенов среди их белков.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.  

 

* - цена актуальна только для физических лиц
В т.ч. НДС 20%