Статья «ГЕНОТИПИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ Mycobacterium avium subsp. hominissuis, "Генетика"»

Нетуберкулезные микобактерии вида Mycobacterium avium ? типичные обитатели окружающей среды, способные вызывать микобактериоз ? инфекционное заболевание диких и домашних животных, птиц и человека. В настоящей работе представлены результаты первого молекулярно-генетического исследования российской популяции M. avium. Объектом изучения были 85 штаммов M. avium, выделенных от различных групп эпидемиологически не связанных пациентов в Cанкт-Петербурге и Ленинградской области в 2008?2011 гг. Принадлежность штаммов к M. avium subsp. hominissuis была установлена на основе анализа инсерционных элементов IS901 и IS900 и полиморфизма фрагментов рестрикции гена hsp65. VNTR-типирование по восьми локусам (292, X3, 25, 47, 3, 7, 10 и 32 согласно международной схеме Thibault et al., 2007), впервые примененное для характеристики российской популяции M. avium, выявило генетическую неоднородность штаммов возбудителя микобактериоза человека. Шесть VNTR-типов с идентичными 8-значными числовыми профилями (число повторов в локусах) из 15 вариантов представлены кластерами, в состав которых входили 76 (89.4%) штаммов. Наиболее крупные кластеры с числовыми профилями 22221128 и 24221128 включали 45 (59.2%) и 15 штаммов (19.7%), соответственно; остальные кластеры содержали от двух до семи штаммов. Штаммы кластера 25331128 отличались от остальных “усеченным” локусом TR10 (аллель 2). Учитывая, что заражение человека осуществляется от источников окружающей среды, высокий уровень кластеризации изученных штаммов M. avium при отсутствии связи между случаями заболевания можно объяснить невысокой вариабельностью (индекс разнообразия HGDI 0?0.61) восьми локусов VNTR.