Статья «МЕХАНИЗМ СВОРАЧИВАНИЯ ТРАНСАКТИВАЦИОННОГО ДОМЕНА Е-БЕЛКОВ ПРИ ВЗАИМОДЕЙСТВИИ С KIX-ДОМЕНОМ КОАКТИВАТОРА ТРАНСКРИПЦИИ CBP, "Цитология"»

Внутренне неупорядоченные белки, неспособные образовывать компактную упорядоченную структуру за счет самоорганизации, могут подвергаться компактизации при взаимодействии с партнерами, если свободная энергия возникающего комплекса меньше свободной энергии белка и партнера до взаимодействия. В частности, при комплексообразовании неупорядоченного трансактивационного домена белков Е-семейства с KIX-доменом коактиватора транскрипции CBP TAD претерпевает конформационный переход типа неупорядоченный клубок-спираль. В настоящей работе охарактеризованы конформационные изменения TAD и его мутантной формы L20P в различных растворителях. Это позволило установить механизм упорядочивания структуры этого домена. Показано, что условия макромолекулярного краудинга, создаваемого высококонцентрированными растворами полиэтиленгликоля, изменение рН, ионной силы раствора, а также присутствие осмолитов (саркозина и таурина) не вызывают компактизации структуры TAD. В то же время существенное упорядочивание структуры TAD было зарегистрировано в растворах TMAO и в растворах спиртов - TFE, этанола и HFIP. Полученные данные позволили заключить, что упорядочивание TAD обусловлено его дегидратацией. Соответственно мы предположили, что приобретение TAD альфа-спиральной структуры при связывании с KIX также обусловлено вытеснением воды из ближайшего окружения TAD. Для проверки этой гипотезы была исследована структура мутантной формы TAD с заменой L20P в различных растворителях. Известно, что эта замена ослабляет взаимодействие белков Е-семейства с KIX. Показано, что структура мутантной формы TAD/L20P практически не изменяется в растворах спиртов. Эти данные подтвердили наше предположение об упорядочивании TAD при взаимодействии с KIX вследствие дегидратации taD.