Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «ОСОБЕННОСТИ МЕХАНИЗМА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ КАТАЛИТИЧЕСКИХ АНТИТЕЛ С ФОСФОРОРГАНИЧЕСКИМИ СУБСТРАТАМИ, "Молекулярная биология"»

Авторы:
  • Мокрушина Ю.А.1
  • Пипия С. О.2
  • Степанова А.В.3
  • Шамборант О. Г.4
  • Кнорре В.Д.5
  • Смирнова И. В.6
  • Габибов А.Г.7
  • Воробьев И. И.8
стр. 958-968
Платно
1 Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, 117997, 2 Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, 3 Институт геологии Карельского НЦ РАН, 4 Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, 5 Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 6 Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук; Казанский федеральный университет, 7 Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 8 Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук; Центр "Биоинженерия" Российской академии наук
Ключевые слова:
  • каталитические антитела
  • фосфорорганические соединения
  • механизм индуцированного соответствия
  • catalytic antibodies
  • organophosphorus compounds
  • induced-fit mechanism
Аннотация:
Каталитические антитела рассматривают как перспективную модель для создания высокоспецифичных биокатализаторов с заданной активностью, однако для реализации направленного изменения или улучшения их свойств необходимо понимание основ катализа и специфичности взаимодействия с субстратами. В данной работе проведено структурно-функциональное исследование Fab-фрагмента антитела А5 и сравнительный анализ его свойств с антителом А17. Указанные антитела отобраны ранее по способности ковалентно взаимодействовать с фосфорорганическими соединениями. Установлено, что антитело A5 обладает исключительной специфичностью к фосфонату X с бимолекулярными константами скорости реакции 510 ± 20 и 390 ± 20 мин-1М-1 для каппа- и лямбда-вариантов соответственно. Моделирование пространственной структуры антитела А5 позволило установить, что реакционноспособный остаток L-Y33 расположен на поверхности активного центра, в отличие от антитела А17, у которого реакционноспособный остаток L-Y37 расположен на дне глубокого гидрофобного кармана. Для детализации механизма реакции созданы мутанты антитела А5 с заменами L-R51W и H-F100W, использование которых позволило провести исследования в режиме предстационарной кинетики. Триптофановые мутанты получены в виде Fab-фрагментов в экспрессионной системе метилотрофных дрожжей Pichia pastoris, установлено, что эффективность их взаимодействия с фосфонатом Х сравнима с антителом дикого типа. Методом кинетики в остановленной струе идентифицированы значительные конформационные изменения антитела А5 в процессе модификации фосфонатом. Определено, что реакция протекает по механизму индуцированного соответствия, рассчитаны кинетические параметры элементарных стадий процесса. Полученные результаты открывают перспективы дальнейшего совершенствования биокатализаторов на основе антител.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.