Статья «ДИНАМИКА УРОВНЯ МЕТИЛИРОВАНИЯ РЕТРОТРАНСПОЗОНОВ LINE-1 ВО ВНЕКЛЕТОЧНОЙ ДНК БОЛЬНЫХ РАКОМ ЛЕГКОГО НА ФОНЕ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ ТЕРАПИИ, "Молекулярная биология"»

Основные признаки аберрантного метилирования ДНК клеток опухоли - гиперметилирование промоторов некоторых генов и гипометилирование значительной части ДНК, в частности ретро-транспозонов. Известно, что в ткани при раке легкого (РЛ) ретротранспозоны семейства LINE-1 гипометилированы. Известно также, что при онкологических заболеваниях в циркулирующей ДНК (цирДНК) плазмы и в цирДНК, связанной с поверхностью клеток крови (скп-цирДНК), накапливаются фрагменты специфичных для опухоли аберрантно метилированных ДНК, что позволяет использовать их в качестве онкомаркеров. Мы исследовали уровень метилирования повторов LINE-1 в цирДНК крови 16 больных раком легкого - до и после терапии. ЦирДНК выделяли из плазмы крови, скп-цирДНК - из фракции, полученной после обработки клеток крови фосфатным буфером и затем раствором трипсина. Концентрацию метилированных фрагментов района 1 LINE-1 (LINE-met) определяли, используя метод количественной метил-специфичной ПЦР. Для нормирования данных по метилированию оценивали концентрацию всех фрагментов LINE-1 района 2 (LINE-Ind) - независимо от степени их метилирования по показаниям метода количественной ПЦР. Показана корреляция между концентрацией метилированных фрагментов LINE-met и фрагментами LINE-Ind в составе скп-цирДНК до лечения (r = 0.54), после химиотерапии (r = 0.72), после операции (r =0.83) (р < 0.05, коэффициент ранговой корреляции Спирмена). В общей группе больных уровень метилирования повторов LINE-1, определенный как отношение концентрации LINE-met относительно LINE-Ind , статистически значимо возрастает после химиотерапии (р < < 0.05, парный t-тест) и после операции - при сравнении с уровнем до лечения (р < 0.05, парный t-тест). Обнаружена взаимосвязь между индексом метилирования LINE-1 в скп-цирДНК крови и гистологическим типом опухоли (аденокарциномой и плоскоклеточным раком легкого). Наши результаты свидетельствуют о перспективности исследований динамики изменений уровня метилирования повторов LINE-1 при различных схемах противоопухолевого лечения.