Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «АНАЛИЗ ГЕНОМА ПОЛИЭКСТРЕМОФИЛЬНОЙ АРХЕИ SP. MBA-1, ДОМИНИРУЮЩЕЙ В МИКРОБНОМ СООБЩЕСТВЕ РЕАКТОРА БИОВЫЩЕЛАЧИВАНИЯ, "Микробиология"»

Авторы:
  • Булаева А. Г.1
  • Каныгина А. В.2
  • Манолов А.И.3
стр. 80-87
Платно
1 Институт микробиологии им. С.Н. Виноградского, Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, 2 Московский физико-технический институт (государственный университет); Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины ФМБА, 3 ФГБУН Институт высшей нервной деятельности и нейрофизиологии
  • В выпуске: №1, 2017, Том 86
  • В журнале: Микробиология
  • Издательство: ФГУП «Издательство «Наука»
  • Рубрика ГРНТИ: Биологические науки
  • Год выхода: 2017
Ключевые слова:
  • Ferroplasmaceae
  • Acidiplasma
  • ацидофилы
  • геном
  • высокопроизводительное секве-нирование
  • окисление железа и серы
  • Ferroplasmaceae
  • Acidiplasma
  • acidophiles
  • genome
  • high-throughput sequencing
  • iron and sulfur oxidation
Аннотация:
В работе представлены результаты анализа генома штамма Acidiplasma sp. MBA-1 - представителя экстремально ацидофильных умеренно термофильных архей семейства Ferroplasmaceae, аэробно окисляющих двухвалентное железо и потребляющих органические вещества. Ранее было показано, что данный штамм являлся доминирующим в микробном сообществе, осуществлявшем процесс биоокисления пирит-арсенопиритного золотосодержащего концентрата. Секвенирование генома было выполнено на платформе Illumina HiSeq 2000. Было получено 2306800 парных ридов, что соответствовало примерно 300-кратному покрытию. Сборка проводилась параллельно тремя программами-сборщиками. Оптимальная сборка включала 9 контигов, размер генома составлял 1747364 п.н., значение N50 - 446845 п.н. Аннотация генома показала наличие 1749 белок-кодирующих последовательности, а также 46 генов тРНК и одной копии генов рРНК. Результаты анализа генома подтвердили результаты исследования физиологических свойств, выполненные ранее. В составе генома был идентифицирован ген голубого медьсодержащего белка сульфоцианина (TZ01 06185) - ключевого белка ЭТЦ окисления железа. Были также идентифицированы гены ферментов окисления серы: оксидоредуктазы серы (TZ01 04750), сульфат-аденилилтрансферазы (TZ01 04545). Были выявлены гены, участвующие в транспорте и катаболизме органических веществ, а кроме того обнаружены гены 3-гидроксипропионатного/4-гидроксибутиратного цикла. Геном штамма Acidiplasma sp. MBA-1 является первым геномом рода, депонированным в общедоступной базе данных DDBJ/EMBL/GenBank (номер JYHS00000000), и представляет интерес для дальнейших исследований архей рода Acidiplasma.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.