Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ КОМПЛЕКСОВ ПИРИМИДИНФОСФОРИЛАЗ NP-I- И NP-II-СЕМЕЙСТВ C 6-МЕТИЛУРАЦИЛОМ, "Кристаллография"»

Авторы:
  • Прокофьев И.И.1
  • Лашков А.А.2
  • Габдулхаков А.Г.3
  • Балаев В.В.4
  • Миронов А.С.5
  • Бетзель Х.
  • МИХАЙЛОВ А.М.6
стр. 415-424
Платно
1 Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН, Москва, Россия, 2 Институт кристаллографии РАН, Москва, 3 Институт белка, 4 Институт кристаллографии РАН, 5 Институт кристаллографии РАН, Москва, Россия E-mail: alashkov83@gmail.com, 6 Институт проблем управления им. В.А. Трапезникова РАН
Аннотация:
Впервые определена структура комплекса бактериальной уридинфосфорилазы (УФазы), принадлежащей семейству NP-I, с 6-метилурацилом с разрешением 1.17 ?.?Выявлены структурные особенности молекулы бактериальной УФазы холерного вибриона (VchUPh), ответственные за селективность 6-метилурацила как псевдосубстрата. Установлено, что отталкивание гидрофильной гидроксигруппы аминокислотного остатка Thr93 активного центра VchUPh гидрофобной метильной группой 6-метилурацила приводит к тому, что атом кислорода O4? рибозной компоненты и O3P фосфатной группы рибозо-1-фосфата не образуют c OG1_Thr93 водородных связей, необходимых для проведения ферментативной реакции, что, вероятно, препятствует проведению VchUPh ферментативной реакции синтеза 6-метилиуридина из 6-метилурацила. Таким образом, выявлен аминокислотный остаток, модификация которого позволит VchUPh осуществлять биотехнологически значимую реакцию синтеза 6-метилуридина из 6-метилурацила. Учитывая высокую гомологию структуры функционально значимых областей молекул бактериальных УФаз, этот вывод справедлив и для других бактериальных УФаз. Для бактериальных тимидинфосфорилаз, принадлежащих семейству NP-II, установлено, что связывание 6-метилурацила с ферментом невозможно в необходимой для катализа конфигурации вследствие близкого контакта 6-метильной группы и Phe210.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.