Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «КОМУ ОН НУЖЕН, ЭТОТ МУСОР, ИЛИ ТЕМНАЯ МАТЕРИЯ ГЕНОМА, "Биохимия"»

Авторы:
  • Подгорная ’ О. И.1
  • Остромышенский Д. И.2
  • Енукашвили Н. И.3
стр. 607-624
Платно
1 Институт цитологии РАН; Дальневосточный федеральный университет, 2 Институт цитологии РАН, 3 Институт цитологии РАН
  • В выпуске: №4, 2018, Том 83
  • В журнале: Биохимия
  • Издательство: ФГУП «Издательство «Наука»
  • Рубрика ГРНТИ: Химия. Биология. Медицина.
  • Год выхода: 2018
  • SDI: 007.001.0320-9725.2018.083.004.15
  • УДК: 576.315
Ключевые слова:
  • гетерохроматин
  • секвенирование
  • тандемные повторы
  • диспергированные повторы
  • мобильные элементы
  • ретропозоны
  • длинные некодирующие РНК
  • in situ гибридизация
  • heterochromatin
  • sequencing
  • tandem repeats
  • transposable elements
  • retrotransposons
  • long noncoding RNA (lncRNA)
  • in situ hybridization
Аннотация:
Центромеры (ЦЕН), перицентромерные районы (периЦЕН) и районы субтеломер (субТел) - районы конститутивного гетерохроматина (ГХ). Основным компонентом ГХ являются тандемные повторы (сателлитная ДНК), которые у мыши и человека составляют не менее 10% генома. В интерфазном ядре у многих видов ГХ организован в виде четко очерченных структур в ядре - хромоцентры. В обзоре рассмотрены основные классы последовательностей ГХ в порядке возрастания их количества в ридах после секвенирования хромо-центров мыши (ChrmC). Тандемные повторы составляют ~70% ChrmC. На втором месте - Non-LTR ретро-позоны (в основном, LINE) На третьем месте - эндогенные ретровирусы (~9%). ГХ не обогащен ERV по сравнению с целым геномом, однако наблюдаются различия в распределении отдельных элементов: если в целом геноме наиболее распространенными являются MaLR-подобные элементы (ERV3), то в ГХ преобладают IAP и соответствующие им LTR (ERV2). Большинство LINE ChrmC представлено фрагментом 2 т.н.п. конца 2-й ORF и фланкирующего района. Почти все тандемные повторы (ТП), тестированные как ЦЕН или периЦЕН, входят в состав ChrmC. Из 60 новых семейств ТП, найденных при классификации, 29 семейств нет в ChrmC, что предполагает их расположение на плечах хромосом. Транскрипция ТП необходима для поддержания конденсированного состояния ГХ, но особенно важны всплески транскрипции ТП, сопровождающие нормальный эмбриогенез и другие моменты кардинальной смены клеточной программы, в том числе при канцерогенезе. В обзоре обсуждается недавно открытый глобальный механизм эпигенетической регуляции с помощью транскриптов некодирующих последовательностей - длинных некоди-рующих РНК (lncRNA), его роль в эмбриогенезе и поддержании плюрипотентности.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.