Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста
Войти / Регистрация
Корзина

  • Ваша корзина пуста

Статья «ИДЕНТИФИКАЦИЯ ЕДИНИЧНЫХ АМИНОКИСЛОТНЫХ ЗАМЕН В ПРОТЕОГЕНОМИКЕ, "Биохимия"»

Авторы:
  • Мошковский С.А.1
  • Иванов М.В.2
  • Кузнецова К.Г.3
  • Горшков М.В.4
стр. 368-378
Платно
1 ФГБУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН, 2 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, 3 НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича, 4 Институт энергетических проблем химической физики им. В.Л. Тальрозе Российской академии наук 119334 Москва, Ленинский просп., 38, стр. 2
  • В выпуске: №3, 2018, Том 83
  • В журнале: Биохимия
  • Издательство: ФГУП «Издательство «Наука»
  • Рубрика ГРНТИ: Химия. Биология. Медицина.
  • Год выхода: 2018
  • SDI: 007.001.0320-9725.2018.083.003.5
  • УДК: 577.112
Ключевые слова:
  • proteogenomics
  • proteomics
  • mass spectrometry
  • single amino acid polymorphism
  • single nucleotide polymorphism
Аннотация:
Одной из задач протеогеномики, сочетающей данные высокопроизводительного анализа нуклеиновых кислот и белков, является надежная идентификация единичных аминокислотных замен - основного источника вариации геномов в их кодирующей части. Точное знание отклонений от консенсусного генома может использоваться в различных биомедицинских приложениях, например для оценки профиля экспрессии генома злокачественной опухоли, в исследовании механизмов гетерозиготности, для идентификации неоантигенов опухолей при разработке противораковых вакцин, для изучения редактирования матричной РНК на уровне белков и др. Получение этих знаний связано с обработкой больших массивов экспериментальных данных, нарабатываемых методами масс-спектрометрии высокого разрешения, в которых искомая информация о точечных изменениях последовательностей белков, зачастую, с трудом достижима. Соответственно, одной из наиболее существенных проблем является присутствие высокого уровня ложноположитель-ных идентификаций пептидов с заменами в результатах протеогеномного анализа. В обзоре мы обсуждаем подходы, развиваемые в последние годы для корректной обработки протеомных данных, позволяющей проводить более надежную идентификацию единичных аминокислотных замен, в особенности с различением модификаций аминокислотных остатков, происходящими in vitro и in vivo. Оптимальные методы оценки уровня ложноположительных результатов сокращают приборное и вычислительное время на подтверждение значимых белковых идентификаций ортогональными методами.

Архивные статьи (2015 год и ранее) доступны для ознакомления бесплатно, для скачивания их необходимо приобрести. Для просмотра материалов необходимо зарегистрироваться и авторизоваться на сайте.

Чтобы приобрести доступ к материалу для юридического лица, пожалуйста, свяжитесь с администрацией портала с помощью формы обратной связи либо по электронному адресу libnauka@naukaran.com.  

Действия с материалами доступны только авторизованным пользователям.