Статья «ФЕМТО- И ПИКОСЕКУНДНАЯ ДИНАМИКА ПЕРВИЧНЫХ РЕАКЦИЙ РЕКОМБИНАНТНОГО БАКТЕРИОРОДОПСИНА В СРАВНЕНИИ С ПРИРОДНЫМ БЕЛКОМ В ТРИМЕРНОМ И МОНОМЕРНОМ СОСТОЯНИЯХ, "Биохимия"»

Динамика образования первичных интермедиатов фотоцикла рекомбинантного бактериородопсина (БР) была исследована методом фемтосекундной абсорбционной лазерной спектроскопии с разрешением 25 фс. БР был получен в экспрессионной системе E. coli. Поскольку БР был получен в мицеллярной системе DMPC-CHAPS в мономерном состоянии, было проведено его сравнение с тримерной и мономерной формами природного бактериородопсина (БР и БР соответственно). Показано, что интермедиат I БР (возбужденное состояние) образуется в пределах 100 фс, как и у образцов БР и БР. Дальнейшие процессы, а именно распад возбужденного состояния БР и образование интермедиатов J и K, происходят несколько медленнее по сравнению с БР, но близки по своим характеристикам к БР. Время жизни интермедиата I, судя по сигналу AA (470-480 нм), составило 0,68 пс (78%) и 4,4 пс (22%) для БР, 0,52 пс (73%) и 1,7 пс (27%) для БР и 0,45 пс (90%) и 1,75 пс (10%) для БР. Время образования интермедиата K, судя по сигналу AA(625-635 нм), составило 13,5 пс для БР, 9,8 пс БР и 4,3 пс для БР. Также наблюдается некоторое уменьшение эффективности фотореакции БР и БР по сравнению с БР, что видно по падению поглощения интермедиата K в дифференциальном спектре на ~14%. Поскольку БР по своим фотохимическим свойствам близок к природному белку в мономерном состоянии, то БР и его мутантные формы могут служить основой для дальнейшего изучения механизма функционирования бактериородопсина.