Статья «УНИКАЛЬНЫЕ КОМБИНАЦИИ ???-ЕДИНИЦ И П-ОБРАЗНЫХ МОДУЛЕЙ В БЕЛКАХ И ОСОБЕННОСТИ ИХ АМИНОКИСЛОТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ, "Молекулярная биология"»

В настоящей работе проведен анализ возможных комбинаций между ???-единицами и П-модулями, которые можно встретить в обеих формах белков - правых и левых. Впервые установлена взаимо­связь взаимного расположения структурных элементов в цепи и пространстве с их хиральностью. В наиболее часто встречающихся ???П-комбинациях, в которых в цепи сначала расположена ???- единица, а за ней П-модуль, оба элемента - правые. В П???-комбинациях, где ближе к N-концу расположен П-модуль, а затем ???-единица, П-модуль - левый, а ???-единица - правая. В редко встречающихся комбинациях левых ???-единиц и правых П-модулей в цепи сначала идет П-модуль, а затем ???-единица. Комбинации левых П-модулей и левых ???-единиц в белках не найдены. В работе также показано, что П-модули, структура которых может быть представлена как ?-тяж-?-спираль-дуга-?-тяж, в белках обнаружены только в правой форме, и в большей части из них (51%) в дугах содержатся остатки cis-пролинов. При наложении структуры таких дуг, взятых из различных негомологичных белков, практически совпадают, так же как и позиции cis-пролинов. Наложение друг на друга целых П-модулей, взятых из негомологичных белков, показывает, что их структуры также очень похожи. Структурное выравнивание аминокислотных последовательностей П-модулей позволило определить ключевые позиции, в которых должны находиться гидрофобные и гидрофильные остатки, а также глицины и cis-пролины.