Статья «ВИДОВОЕ РАЗНООБРАЗИЕ МАГНИТОТАКТИЧЕСКИХ БАКТЕРИЙ РЕКИ ОЛЬХОВКА, "Микробиология"»

Методом магнитной сепарации из образцов воды и ила р. Ольховка (г. Кисловодск) была получена фракция магнитотактических бактерий, из тотальной ДНК которой с помощью ПЦР и дальнейшего клонирования получена библиотека клонов фрагментов генов 16S рРНК. В результате филогенетического анализа 67 последовательностей случайно выбранных клонов было показано, что магнитотактические бактерии представлены в библиотеке двумя филотипами, один из которых включает 42 последовательности, другой ? всего одну последовательность. Остальные 24 последовательности принадлежали немагнитотактическим бактериям. Филогенетический анализ показал, что оба филотипа относились к магнитотактическим коккам, причем последовательности, представленные в библиотеке наибольшим числом клонов, практически полностью идентичны последовательности гена 16S рРНК пресноводного кокка TB24 (X81185.1), идентифицированного ранее среди магнитотактических бактерий озера Чимси (Бавария). Филотип, представленный единственной последовательностью, образует на дендрограмме отдельную ветвь, а его последовательность сходна с TB24 на 97%. Обнаруженные филотипы, вместе с последовательностями некультивируемых пресноводных магнитных кокков, формируют отдельную ветвь внутри класса <i>Alphaproteobacteria</i> и, предположительно, представляют собой отдельное семейство внутри сформированного недавно порядка <i>Magnetococcales.</i> Несмотря на то, что при анализе библиотеки клонов фрагментов генов 16S рРНК, филотипы, принадлежащие магнитотактическим спириллам, не были обнаружены, после вторичного обогащения фракции магнитотактических бактерий с использованием метода “race track” был выделен новый штамм магнитотактических спирилл <i>Magnetospirillum</i> SO-1. Наиболее родственной штамму SO-1 является описанная ранее магнитотактическая спирилла <i>Magnetospirillum magneticum</i> AMB-1.