Статья «Структурные и структурно-дипольные особенности хугстиновских димеров, образующихся из комплементарных нуклеиновых оснований, по данным квантово-механических ab initio исследований, "Биофизика"»

Выполнены квантово-механические ab initio исследования по выявлению структурных и структурно-дипольных особенностей хугстиновских димеров по отношению к уотсон-криковским, образующихся при взаимодействии комплементарных пар оснований. Установлено, что в зависимости от исходного взаиморасположения аденина и тимина могут образовываться как уотсон-криковские, так и хугстиновские димеры. Из гуанина и цитозина димеры хугстиновского типа образуются только в случае, если исходно цитозин был протонирован. Оба вида хугстиновских димеров заметно отличаются от уотсон-криковских по длинам связей и углам между смежными связями, как в пуриновой, так и в пиримидиновой частях димеров. Длины водородных связей у хугстиновских димеров, в общем, короче, а углы водородных связей и углы между ними заметно больше, чем у уотсон-криковских. Существенные различия наблюдаются также по распределению зарядов на атомах и дипольным моментам. В работе предложен способ определения тонкой структуры дипольных моментов и на его основе приведены количественные данные о характере этих различий. Также показано, что значения локальных параметров, в соответствии с кембриджским стандартом классификации параметров, определяющих свойства ДНК, у хугстиновских и уотсон-криковских димеров сильно различаются.